香港中文大学生物医学工程理学硕士课程由生物医学工程学系开设。本课程邀请了来自医学院，生命科学学院和工程学院的教授授课，内容涵盖了生物科学，医学及工程等一系列的重要课题，其中包括生物化学技术，生物信息学，生物力学，生物纳米技术，医学成像，康复，假肢，医疗器械和医疗器械监管等。学生可在课堂中接触到不同范畴的专业人士，从而获取最新资讯及技术内容。该专业的使命是在医疗仪器、生物感测器、生物资讯、生物材料、医学生物科技的广阔领域中，培育一群受良好培养的生物医学工程师作为先驱，以及在生物医学工程学方面栽培未来的行业领袖。

毕业生就业去向主要为：GE医疗，罗氏，葛兰素史克，默沙东公司等世界知名企业。平均起薪：18000港币/月，在香港连续居住7年后即可申请香港PR。

拥有认可大学的相关工程，科学或医学学科的英联邦大学学士学位，成绩通常不低于二等；或毕业于认可大学的荣誉专业，获得学士学位，本科课程的平均成绩通常不低于B级；或在大学院校完成了课程学习，并获得了与相关领域的荣誉学位相当的专业或类似资格（成绩不低于二等）；或毕业于其他领域，但拥有与生物医学工程和/或科学和技术相关的适当经验

托福 79或雅思6.5；GMAT （语文）：21

必修课程：

生物医学工程导论

基础生物医学

选修课程：

组织工程
生物微机电系统与生物光子学
医疗设备与传感器网络
医疗机器人技术
生物电子学与纳米技术
生物信息学
虚拟医学与计算机辅助手术
医学成像
生物医学工程实验室
医疗器械监管事务与知识产权
电子健康技术
黄金时代机遇与可持续智慧老龄化

理学硕士项目

据院校官网数据，2013-2016年的毕业生中，27%从事工程产品支持工作，26%继续攻读更高学位，17%从事实验室研究工作，17%从事医学销售和市场营销工作，17%从事其他工作。毕业生的雇主有西门子、飞利浦、香港应用科技研究院、机电工程署、香港港安医院、港怡医院、香港科学馆等。